feat: 新增 diag_refs — source_ref↔manifest 對帳診斷

lint 的「source_ref 不在 manifest」只報對不上、不辨成因。diag_refs 把每個
對不上的 source_ref 分成五類（hash 不符／路徑字串岔開／檔名 hash 後綴岔開／
檔在磁碟未登記／完全無對應），各附修法，讓「補帳本（§14.3）」與「修規則
（§12）」的相反處置不再混為一談。純唯讀、結束碼 0/1，可當搬機或改 manifest
後的閘門。附 selfcheck 驗五型別分類、結束碼與零寫檔。README §3.3/§6/§7/§8 同步。

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>

README.md

@@ -126,6 +126,16 @@ ollama list        # 對照 tasks.ingest.model / tasks.lint.model / tasks.fallba
 - **結束碼**：`0` = 無發現；`1` = 有待人工核准項目（供 CI 判斷 / 標紅通知）。
 - 排程：[.gitea/workflows/lint.yaml](.gitea/workflows/lint.yaml)（每週一台北時間 05:00，草稿，部署 Gitea 時啟用）。
 
+> **`source_ref 不在 manifest` 的成因分類**：lint 只報「對不上」，不分辨成因。跑
+> [tools/diag_refs.py](tools/diag_refs.py) 把每個對不上的 source_ref 分成五類（hash 不符 /
+> 路徑字串岔開 / 檔名 hash 後綴岔開 / 檔在磁碟未登記 / 完全無對應），各附修法——
+> 「補帳本」（§14.3）與「修規則」（§12）的處置相反，先分類再動手。純唯讀不改任何檔，
+> 結束碼同 lint（`0` 全部解得開 / `1` 有對不上），可當搬機或改 manifest 後的閘門。
+>
+> ```powershell
+> .venv\Scripts\python tools\diag_refs.py
+> ```
+
 ### 3.4 查詢 `search` — BM25 檢索
 
 ```powershell
@@ -180,7 +190,7 @@ wiki/entities/       # 實體頁（系統/模組/API/法規/專案）
 wiki/concepts/       # 概念頁（跨來源綜合）
 index.md             # 目錄式導航（由 ingest 自動重建）
 log.md               # append-only 操作日誌
-tools/               # convert/ ingest.py lint.py search.py kb.py（共用模組）
+tools/               # convert/ ingest.py lint.py diag_refs.py search.py kb.py（共用模組）
 mcp/server.py        # MCP 薄殼
 ```
 
@@ -197,6 +207,7 @@ mcp/server.py        # MCP 薄殼
 | `須在 main 分支執行` | 攝入前先切回 `main`。 |
 | `工作區有 raw/ 以外的未提交變更` | 先 commit / stash 非 `raw/` 的變更再攝入。 |
 | `... 不在 manifest 的 converted 條目中` | 該來源尚未轉換；先跑 `convert.py`。 |
+| lint 報 `source_ref 不在 manifest` | 跑 `tools/diag_refs.py` 分類成因：帳本掉條目→補登走 PR（§14.3）；路徑字串岔開→修規則（§12），別逐頁改。 |
 | `LLM 輸出驗證失敗（含 fallback）` | 本地模型連主模型 + fallback 都無法產出合規 JSON；檢查 Ollama 是否在線、模型是否拉好。 |
 | `push 失敗（無 remote 或離線）` | 正常；分支已保留本地，手動 push 後開 PR。 |
 
@@ -210,5 +221,6 @@ mcp/server.py        # MCP 薄殼
 .venv\Scripts\python tools\convert\selfcheck.py
 .venv\Scripts\python tools\selfcheck_ingest.py
 .venv\Scripts\python tools\selfcheck_lint.py
+.venv\Scripts\python tools\selfcheck_diag_refs.py
 .venv\Scripts\python tools\selfcheck_search.py
 ```

tools/diag_refs.py

@@ -0,0 +1,134 @@
+"""source_ref ↔ manifest 對帳診斷（AGENTS.md §7 schema / §14 對帳的輔助工具）。
+
+lint.py 對「source_ref 不在 manifest」只報一句，無法區分成因；本工具把每個
+對不上的 source_ref 分類成可據以修復的型別（見 CAT_TITLE / FIX），讓「帳本掉
+條目」「路徑字串岔開」「檔名 hash 後綴岔開」「檔真的遺失」彼此不再混為一談。
+
+純唯讀——不改任何檔（含 manifest），有對不上以結束碼 1 表示（可當搬機／改
+manifest 後的閘門）。分類邏輯與 lint 一致：以最後一個 '#' 切出 path 與 sha8。
+
+用法：python tools/diag_refs.py [--root DIR]
+結束碼：0 = 全部解得開，1 = 有對不上。
+"""
+import argparse
+import json
+import pathlib
+import re
+import sys
+
+sys.path.insert(0, str(pathlib.Path(__file__).parent))
+import kb
+
+CAT_TITLE = {
+    "hash-mismatch": "Hash 不符（帳本有此路徑，但 sha256 與 ref 不同）",
+    "normalize": "路徑字串岔開（正規化後與帳本 key 相同：斜線／前綴／大小寫）",
+    "stem": "檔名 hash 後綴岔開（帳本有同檔名幹、hash 後綴不同的 key）",
+    "unregistered": "檔在磁碟、帳本無此條目",
+    "absent": "完全無對應（帳本、磁碟、檔名幹皆無）",
+}
+FIX = {
+    "hash-mismatch": "raw 被就地改動或重轉（違反 §1.4）；還原檔案，或連同 source_ref 走 PR（§14.2）。",
+    "normalize": "修產生岔開字串的那一個環節（路徑正規化），別逐頁改 source_ref（§12 change the ruler）。",
+    "stem": "source_ref 指到不同 hash 後綴的檔名；核對正確檔名，別改帳本去遷就（§14.2）。",
+    "unregistered": "帳本掉了條目、檔還在；走 branch+PR 補登 manifest（§14.3），別動 wiki 頁。",
+    "absent": "source_ref 可能攝入時寫歪，或原始檔真的遺失；上報 HITL 據實記錄（§14.2）。",
+}
+# 分類輸出順序（愈可機械修復的排愈前）
+ORDER = ["hash-mismatch", "normalize", "stem", "unregistered", "absent"]
+
+
+def _norm(path):
+    """正規化路徑字串以偵測「同一檔、不同寫法」：反斜線→斜線、去開頭 ./、轉小寫。"""
+    s = path.replace("\\", "/")
+    if s.startswith("./"):
+        s = s[2:]
+    return s.lower()
+
+
+def _stem(path):
+    """取檔名幹：去目錄、去 .md、去結尾的 -<8 碼 hex>（convert 的檔名 hash 後綴）。"""
+    name = path.replace("\\", "/").rsplit("/", 1)[-1]
+    name = re.sub(r"\.md$", "", name, flags=re.I)
+    return re.sub(r"-[0-9a-f]{8}$", "", name, flags=re.I).lower()
+
+
+def classify_ref(source_ref, files, exists):
+    """把單一 source_ref 分類。files：manifest['files']（path→entry）；
+    exists(path)→bool 判磁碟是否有該檔。回傳 (category, detail)。
+    category 為 "resolved" 或 CAT_TITLE 的任一鍵。"""
+    path, _, sha8 = str(source_ref).rpartition("#")
+    entry = files.get(path)
+    if entry is not None:
+        if entry["sha256"].startswith(sha8):
+            return "resolved", path
+        return "hash-mismatch", f"帳本 sha256={entry['sha256'][:8]} ≠ ref #{sha8}"
+    norm = _norm(path)
+    for k in files:
+        if _norm(k) == norm:
+            return "normalize", f"帳本 key = '{k}'"
+    stem = _stem(path)
+    for k, e in files.items():
+        if e.get("kind") == "converted" and _stem(k) == stem:
+            return "stem", f"帳本 key = '{k}'"
+    if exists(path):
+        return "unregistered", f"磁碟有 '{path}'，帳本無此 key"
+    return "absent", f"'{path}' 帳本無、磁碟無、無同名幹 key"
+
+
+def collect(root, files, exists):
+    """掃全庫 wiki 頁，回傳 (findings, n_refs)。findings：category→[(page, ref, detail)]。"""
+    findings = {c: [] for c in ORDER}
+    n_refs = 0
+    for p in kb.iter_pages(root):
+        rel = p.relative_to(root).as_posix()
+        try:
+            meta, _ = kb.parse_page(p.read_text(encoding="utf-8"))
+        except Exception as e:
+            findings["absent"].append((rel, "(無法解析頁面)", str(e)))
+            continue
+        for s in meta.get("sources") or []:
+            n_refs += 1
+            cat, detail = classify_ref(s, files, exists)
+            if cat != "resolved":
+                findings[cat].append((rel, str(s), detail))
+    return findings, n_refs
+
+
+def format_report(findings, n_refs):
+    total = sum(len(v) for v in findings.values())
+    lines = [f"檢查 source_ref：{n_refs}，對不上：{total}", ""]
+    if total == 0:
+        lines.append("全部解得開（source_ref 與 manifest 一致）。")
+        return "\n".join(lines)
+    for cat in ORDER:
+        items = findings[cat]
+        if not items:
+            continue
+        lines.append(f"## {CAT_TITLE[cat]}（{len(items)}）")
+        lines.append(f"→ 修法：{FIX[cat]}")
+        for page, ref, detail in items:
+            lines.append(f"  - [{page}] {ref}")
+            lines.append(f"      {detail}")
+        lines.append("")
+    return "\n".join(lines)
+
+
+def main(argv=None):
+    ap = argparse.ArgumentParser(description=__doc__)
+    ap.add_argument("--root", default=str(kb.ROOT))
+    a = ap.parse_args(argv)
+    root = pathlib.Path(a.root).resolve()
+    mpath = root / "raw" / "manifest.json"
+    try:
+        files = json.loads(mpath.read_text(encoding="utf-8"))["files"]
+    except (OSError, KeyError, json.JSONDecodeError) as e:
+        raise SystemExit(f"讀不到 / 解析不了 manifest：{mpath}（{e}）")
+
+    findings, n_refs = collect(root, files, lambda p: (root / p).is_file())
+    print(format_report(findings, n_refs))
+    if sum(len(v) for v in findings.values()):
+        raise SystemExit(1)
+
+
+if __name__ == "__main__":
+    main()

tools/selfcheck_diag_refs.py

@@ -0,0 +1,114 @@
+"""Phase 4 自檢：沙盒植入五種 source_ref 岔開型別（hash 不符、路徑正規化、
+檔名 hash 後綴岔開、檔在磁碟未登記、完全無對應）＋一個正常解得開的 ref，
+驗證 diag_refs 逐一分類正確、報告涵蓋各型別、結束碼 1、且不修改任何檔案。
+另驗全部解得開時結束碼 0。
+
+執行：.venv/Scripts/python tools/selfcheck_diag_refs.py
+"""
+import io
+import json
+import pathlib
+import shutil
+import sys
+import tempfile
+from contextlib import redirect_stdout
+
+sys.path.insert(0, str(pathlib.Path(__file__).parent))
+import kb
+import diag_refs
+
+SHA_A = "abcd1234" + "0" * 56
+SHA_B = "beef5678" + "0" * 56
+# 帳本 key 一律 posix 正斜線＋中文/連字號檔名（真實 convert 產出的形狀）
+K_OK = "raw/converted/www-pluspay-faq-06b02fd9.md"
+K_STEM = "raw/converted/www-pluspay-terms-11112222.md"  # 同幹、不同 hash 後綴
+
+FILES = {
+    K_OK: {"kind": "converted", "sha256": SHA_A, "original_path": "raw/originals/faq.html",
+           "original_sha256": SHA_A, "converter": "from_web", "converted_at": "2026-07-01T00:00:00"},
+    K_STEM: {"kind": "converted", "sha256": SHA_B, "original_path": "raw/originals/terms.html",
+             "original_sha256": SHA_B, "converter": "from_web", "converted_at": "2026-07-01T00:00:00"},
+}
+
+# ref → 預期分類。unregistered 的檔會實際落地；absent 的不落地。
+CASES = {
+    "resolved":     f"{K_OK}#abcd1234",
+    "hash-mismatch": f"{K_OK}#deadbeef",
+    "normalize":    r"raw\converted\www-pluspay-faq-06b02fd9.md#abcd1234",  # 反斜線
+    "stem":         "raw/converted/www-pluspay-terms-99998888.md#cccccccc",  # 同幹、異後綴、非 key
+    "unregistered": "raw/converted/www-pluspay-instructions-77776666.md#77777777",
+    "absent":       "raw/converted/www-pluspay-ghost-00001111.md#cafebabe",
+}
+
+
+def unit():
+    """classify_ref 純函式逐型別驗證。"""
+    on_disk = {"raw/converted/www-pluspay-instructions-77776666.md"}
+    exists = lambda p: p in on_disk
+    for expect, ref in CASES.items():
+        cat, detail = diag_refs.classify_ref(ref, FILES, exists)
+        assert cat == expect, f"{ref!r} 應分類為 {expect}，實得 {cat}（{detail}）"
+    print("PASS: classify_ref 六型別（含 resolved）分類正確")
+
+
+def build(root):
+    for sub in ("raw/converted", "wiki/summaries", "wiki/entities", "wiki/concepts"):
+        (root / sub).mkdir(parents=True)
+    (root / "raw/manifest.json").write_text(
+        json.dumps({"version": 1, "files": FILES}), encoding="utf-8")
+    # unregistered 的檔要真的存在於磁碟，才會被判為「檔在、帳本無」而非 absent
+    (root / "raw/converted/www-pluspay-instructions-77776666.md").write_text(
+        "# 未登記\n", encoding="utf-8")
+    today = "2026-07-01"
+    for i, (name, ref) in enumerate(CASES.items()):
+        meta = {"type": "entity", "title": f"頁{name}", "description": "測試頁",
+                "tags": ["t"], "timestamp": today, "sources": [ref], "status": "draft"}
+        (root / f"wiki/entities/p{i}.md").write_text(kb.dump_page(meta, "內文。"), encoding="utf-8")
+
+
+def run(argv):
+    buf = io.StringIO()
+    code = 0
+    try:
+        with redirect_stdout(buf):
+            diag_refs.main(argv)
+    except SystemExit as e:
+        code = e.code
+    return code, buf.getvalue()
+
+
+def main():
+    unit()
+    tmp = pathlib.Path(tempfile.mkdtemp(prefix="ppqa-diag-"))
+    try:
+        root = tmp / "repo"
+        build(root)
+        before = {p: p.read_bytes() for p in root.rglob("*")
+                  if p.is_file()}
+
+        code, out = run(["--root", str(root)])
+        assert code == 1, f"有岔開應以結束碼 1，實得 {code}\n{out}"
+        for cat in ("hash-mismatch", "normalize", "stem", "unregistered", "absent"):
+            assert diag_refs.CAT_TITLE[cat].split("（")[0] in out, f"報告缺型別 {cat}\n{out}"
+        assert "對不上：5" in out, out
+        after = {p: p.read_bytes() for p in root.rglob("*") if p.is_file()}
+        assert before == after, "diag_refs 修改了檔案！"
+        print("PASS: 整合——五型別全報、結束碼 1、零寫檔")
+
+        # 全部解得開 → 結束碼 0
+        good = {"type": "entity", "title": "好頁", "description": "d", "tags": ["t"],
+                "timestamp": "2026-07-01", "sources": [f"{K_OK}#abcd1234"], "status": "draft"}
+        for p in (root / "wiki/entities").glob("*.md"):
+            p.unlink()
+        (root / "wiki/entities/ok.md").write_text(kb.dump_page(good, "內文。"), encoding="utf-8")
+        code, out = run(["--root", str(root)])
+        assert code == 0, f"全部解得開應以結束碼 0，實得 {code}\n{out}"
+        assert "全部解得開" in out, out
+        print("PASS: 全部解得開時結束碼 0")
+        print("ALL PASS")
+    finally:
+        shutil.rmtree(tmp, ignore_errors=True)
+
+
+if __name__ == "__main__":
+    main()